PHP5.4で追加されたビルトインサーバー、便利ですよね。
WordPressのローカル環境構築のためにMAMPいれたり、ローカルにapacheとかnginxとか立てるのもいいですが、ビルトインが一番お手軽で最近使いはじめました。
（http://wald-grun.biz/web/wp/5659/ のような手順で設定）
わりと上手く動いていると思ったのですが
パーマリンク設定を見ると、なぜかURLにindex.phpが含まれている・・・！
（実際にアクセスするとindex.phpは表示されないんですが）
これによって問題が起こるプラグインがあったりして困りました。
http://qiita.com/jshimazu0820/items/1d1d93adbbce875d708e
解決方法
無難といえば無難ですが・・
「カスタム構造」で定義しなおしました。
他のパターンにしたい場合もこのカスタム構造で表現できます問題ないかと思います。
例：
Structure Tagは公式を参考に
https://codex.wordpress.org/Using_Permalinks