結論から言うと、改行コードがCRLFに自動変換されていた
2箇所変える必要があった
git configを書き換える
git config --global core.autoCRLF false
あればですが、.gitattrivbutesを書き換える。(PHPのLaravelの雛形にはデフォルトで置いてあります。。。)
.gitattributes
* text=auto
↑この行を消した。
感想
そうか、2段トラップだったのか。。。
cloneした時点で差分出るんだから、Gitが
犯人なのは明白だったはずなのに、
「Gitは悪く無い・味方のはずだ!!」という先入観から、
真犯人の特定に時間が掛かったパティーン。