この例ではbody直下にあるコメントの内容を一覧で出力します。
index.html
<!DOCTYPE html>
<html>
<head></head>
<body>
<!--hoge-->
foo
<!--piyo-->
bar
<script src="https://code.jquery.com/jquery-2.1.1.min.js"></script>
<script src="main.js"></script>
</body>
</html>
main.js
var $elm = $('body');
var $comment = $elm.contents().filter(function() {
return this.nodeType === document.COMMENT_NODE;
});
$comment.each(function(i, elm) {
console.log(elm.data);
});
[出力]
hoge
piyo