テンプレートから作ったプロジェクトをそのまま実行しようとするとこんなエラーが出て実行できない場合があります。
Problem Occurred
'Launching CocosLuaGame' has encountered a problem.
Error occured while notifying runtime to start logic
Cocos Code IDEはプロジェクトディレクトリのruntime/mac/PrebuiltRuntimeLua.appを起動してそこにluaのソースを転送してデバッグします。新規プロジェクトを作った際にコピーしてきたPrebuiltRuntimeLua.appが壊れている場合このエラーが出るため、ビルドし直すことで解決できます。
プロジェクトを右クリック => Cocos Tools => Build Runtime...を選びます。
完了するとプロジェクトディレクトリのruntime/mac/CocosLuaGame.appにappが出力されているので、このappを実行するようにします。Debug Configurations... => Select Runtime => Runtime pathにビルドしたappを指定します。
あとは⌘F11でデバッグできるようになります。