なにができるの？

sync-settingsはAtomの設定をクラウド(GitHub)経由で同期します。
(Windows8.1や10～Mac間で動作することを確認しています)

以下のものが同期されるようです。
* 初期化スクリプト
* インストールしたパッケージ
* パッケージの設定
* キーマップ
* スニペット ~~(バージョン0.4.0では正しく動作しない模様)~~ v0.6.0で同期を確認

~~執筆時点('15/6/16)では、同期は手動操作で実行します。（自動同期はロードマップには含まれているようです）~~
('16/02/05)v0.6.0では更新のチェックが行われるようです。詳しくは記事の後ろのほうに追記しました。

確認した環境

この記事はWindows8.1、MacOSX10、sync-setting v0.4.0で確認しております。
（'16/2/5に更新された内容についてはWindows10、sync-setting v0.6.0で再確認しました）

GitHubのgistを経由しているため、GitHubのアカウントが必須になります。

Atomの設定画面からパッケージsync-settingsをインストールします。
またはコマンドラインよりapm install sync-settingsを実行します。

GitHubのNew Personal access token画面からアクセストークンを作成します。Select scopesはgistのみチェックを入れれば動くことを確認しています
作成されたトークンをコピーし、Atomのsync-settingsの設定画面のPersonal Access Tokenにペーストします
GitHubのnew gist画面を開き、(空では作成できないため)適当なテキストを入力のうえCreate secret Gistボタンを押します。
上の操作で遷移した画面のURLからgistのID("ユーザー名/"の後に続く英数字部分)をコピーし、Atomのsync-settings設定画面のGist idにペーストします。

設定をバックアップ（アップロード）するには、以下のいずれかを実行します

Ctrl-Alt-U(Win,Mac共通)押下
Ctrl+Shift+P(Win)/Cmd-Shift-P(Mac) 押下でコマンドパレットを表示したうえ、Sync Settings: Backupを実行
メニューバーのPackages > Synchronize Settings > Backupを実行

アップロードが完了すると、Atom上に通知が表示されるかと思います。
先の手順で作成したGistを開くと、アップロードされた設定を確認することができます。
（先の手順で作成したダミーファイルはもう不要なので消していいです）

Gistにバックアップしている環境設定を、別環境にダウンロードして設定反映する方法になります。
リストア（ダウンロード）は環境によってはAtomがしばらく固まってしまう場合もあるようなので、なんの作業も行っていない時に行った方がよさそうです。

設定をリストアするには、以下のいずれかを実行します

Ctrl-Alt-D(Win,Mac共通)押下
Ctrl+Shift+P(Win)/Cmd-Shift-P(Mac) 押下でコマンドパレットを表示したうえ、Sync Settings: Restoreを実行
メニューバーのPackages > Synchronize Settings > Restoreを実行

しばらく待っていると、Atom上に通知が表示されるはずです。
通知完了後、Atomを再起動して設定画面を開けば、設定やパッケージが同期されていることが確認できるかと思います。

Atom起動時にgistのバックアップの確認が行われ、更新されている場合には以下のダイアログが表示されます。

sync-settings: Your settings are out of date.
[Backup] [View backup] [Restore] [Dismiss]

v0.6.0時点において、「Check of update backup」メニューは私の環境では動作している様子がありませんでした。
コマンドパレットにSync Settings: Check of update backupが存在しなかったことから、未実装かバグが疑われます。

フォント設定も同期されてしまうため、同期先のマシンに存在しないフォント設定にされてしまう恐れがあります。フォントを入れるなりフォント複数指定するなりの対応が考えられます。
Atom正規の方法以外でインストールしたパッケージ(例. pronama-chan)は、さすがに設定同期後に自動インストールされたりはしません。設定そのものは同期されているので、手動でパッケージをインストールしておけば同期の恩恵は受けられます。
~~執筆時のバージョン0.4.0では、スニペットのダウンロード先が誤っており(正:snippets.cson → 誤:snippets.coffee)、正しく動作していませんでした。~~(追記 '16/02/05)v0.6.0で正常動作を確認しています

（追記 2016/02/05）
更新が遅れてしまいましたが、v0.6.0より「Upload」「Download」がそれぞれ「Backup」「Restore」と名称変更されていましたので、記事本文を修正しました。
M-ISO様、コメント指摘ありがとうございました。

また、スニペットの同期が正常に行われるようになっていたのを確認し、Atom起動時にバックアップ更新確認が行われるようになっておりましたので、そちらの内容も修正および追記しました。