通常、章や節に番号を付ける場合、以下の用に記載すれば番号が付くと「Sphinx-Users.jp」の逆引き辞典:章や節に番号を振りたいには書いてある。
.. toctree::
:maxdepth: 2
:numbered:
HTMLやePubで出力した場合はこれを追記すれは番号が付くが、rst2pdfを使ってPDF出力をすると番号が付かなくなってしまった。
上記の部分を以下のように変更したら、PDF出力しても番号が付くようになった。
.. section-numbering::
試しにこの状態でHTML出力してみたが、ちゃんと番号が付いていた。
PDFで出力する場合は「.. section-numbering::」の方がいいのかもしれない。
いろいろ試してみる必要がありそう。