http://qiita.com/7of9/items/4e90277b1305f7171188
において、Mac上でビルドした場合は問題ないが、githubにアップロードして、そのファイルを取得したWindows上でビルドした場合、正常動作しなくなっていた。
どうもgitignoreにおいて以下のようにしてしまっていたのが問題のようだ。タグ関連の情報が消失して、正常動作しなくなっていた。
ProjectSettings/*.asset
下記のリンクでも ProjectSettings はignoreしないほうが良いとの記載あり。
gitignore で ProjectSettings 消したら設定が全て死ぬのではないでしょうか?
githubのおすすめのignoreは以下。